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企业出现环境违法行为会对企业的诸多税收优惠政策产生重大影响，包括取消高新技术企业资格并追缴相应的企业所得税、不得享受销售综合利用产品和劳务的增值税即征即退政策、取消软件产业和集成电路产业的其享受税收优惠的资格，并补缴已减免的企业所得税税款等，希望各企业注重环保法规，遵法守法经营，避免给企业带来税收损失。主要列举如下：
情形一、严重环境违法取消高新技术企业资格
根据《财政部 国家税务总局科学技术部关于修订印发<高新技术企业认定管理办法>的通知》（国科发火[2016]32号）第十九条规定，已认定的高新技术企业有下列行为之一的，由认定机构取消其高新技术企业资格：
(一)在申请认定过程中存在严重弄虚作假行为的；
(二)发生重大安全、重大质量事故或有严重环境违法行为的；
(三)未按期报告与认定条件有关重大变化情况，或累计两年未填报年度发展情况报表的。
对被取消高新技术企业资格的企业，由认定机构通知税务机关按《税收征管法》及有关规定，追缴其自发生上述行为之日所属年度起已享受的高新技术企业税收优惠。
情形二、环保违法处罚下达后不得享受增值税即征即退政策
《财政部 国家税务总局关于印发<资源综合利用产品和劳务增值税优惠目录>的通知》（财税[2015]78号）第四条规定，已享受本通知规定的增值税即征即退政策的纳税人，因违反税收、环境保护的法律法规受到处罚（警告或单次1万元以下罚款除外）的，自处罚决定下达的次月起36个月内，不得享受本通知规定的增值税即征即退政策。
情形三、环保违法处罚取消享受优惠政策
《财政部 国家税务总局关于进一步鼓励软件产业和集成电路产业发展企业所得税政策的通知》（财税[2012]27号）第十九条规定，享受上述税收优惠的企业有下述情况之一的，应取消其享受税收优惠的资格，并补缴已减免的企业所得税税款：（一）在申请认定过程中提供虚假信息的；（二）有偷、骗税等行为的；（三）发生重大安全、质量事故的；（四）有环境等违法、违规行为，受到有关部门处罚的。
《财政部 国家税务总局 发展改革委 业和信息化部关于软件和集成电路产业企业所得税优惠政策有关问题的通知》（财税[2016]49号）第二条规定，财税[2012]27号文件所称集成电路生产企业，是指以单片集成电路、多芯片集成电路、混合集成电路制造为主营业务并同时符合下列条件的企业：（一）在中国境内（不包括港、澳、台地区）依法注册并在发展改革、工业和信息化部门备案的居民企业；（二）汇算清缴年度具有劳动合同关系且具有大学专科以上学历职工人数占企业月平均职工总人数的比例不低于40%，其中研究开发人员占企业月平均职工总数的比例不低于20%；（三）拥有核心关键技术，并以此为基础开展经营活动，且汇算清缴年度研究开发费用总额占企业销售（营业）收入（主营业务收入与其他业务收入之和，下同）总额的比例不低于5%；其中，企业在中国境内发生的研究开发费用金额占研究开发费用总额的比例不低于60%；（四）汇算清缴年度集成电路制造销售（营业）收入占企业收入总额的比例不低于60%；（五）具有保证产品生产的手段和能力，并获得有关资质认证（包括ISO质量体系认证）；汇算清缴年度未发生重大安全、重大质量事故或严重环境违法行为。 |
